Смедеревац / Гетти
Кључне Такеаваис
- Честице вируса ЦОВИД-19 откривене су током рутинског испитивања отпадних вода студентских домова на Универзитету у Аризони.
- Школа је одмах уследила након тестирања ученика и особља и идентификовала је две особе које су биле позитивне на ЦОВИД-19, али нису имале симптоме.
- Прича је навела људе да се питају зашто више заједница не тестира урин и измет на ЦОВИД-19.
- Стручњаци кажу да је систем за тестирање већ преоптерећен и да би додавање додатних узорака само повећавало тром ритам резултата.
Током редовног тестирања канализационе канализације у дому, Универзитет у Аризони је у узорцима открио вирус САРС-ЦоВ-2, који узрокује ЦОВИД-19. Универзитет је реаговао тренутним мерама за заустављање потенцијалне епидемије, али прича је покренула питања о зашто узорци урина и столице тек треба да се додају у опције испитивања ЦОВИД-19.
„Све је ово заправо прилично ново“, каже др Аарон Пеацоцк, директор молекуларне биологије у Мицробац Лабораториес, Инц, за Веривелл. „То се заправо није радило редовно ... већина ових компанија које раде [тестирање] отпадних вода су наша комунална предузећа, па су у градовима или окрузима, или су комуналне четврти, и су у великој мери регулисани “.
Паун није био укључен у тестирање канализационе канализације Универзитета у Аризони, али Мицробац Лабораториес тренутно сарађује са другим факултетима и универзитетима на испитивању отпадних вода на број вируса САРС-ЦоВ-2.
Компанија такође сарађује са неким градовима и општинама који су доделили средства за тестирање на САРС-ЦоВ-2. Паун каже да испитивање отпадних вода током пандемије - и иначе - може допунити друге методе испитивања како би кампусима, предузећима и заједницама пружио ширу слику будућих проблема.
Праћење трендова заразе у заједници
Тестирање узорака канализације на број вируса ЦОВИД-19 разликује се од тестирања једне особе истовремено. Различити модели и алгоритми могу помоћи у праћењу општег броја активних инфекција у некој области, а подаци могу помоћи у информисању заједнице о томе да ли случајеви заразе расту, опадају или остају исти.
„Ако то посматрате на овај начин, у балону сте на висини од 10 000 стопа и гледате у шуму, пружајући вам целокупну представу о томе шта се дешава у шуми. Али када тестирате поједине људе, тестирате појединачна стабла “, каже Паун.
Паун каже да САРС-ЦоВ-2 може да се баци у фецес особе пре него што добије симптоме.
„То је својеврсни предзнак онога што се можда спушта на штуку због активних инфекција“, каже он.
По тој логици, откривање честица вируса у отпадним водама могло би помоћи заједницама да раније идентификују случајеве ЦОВИД-19, што се и догодило на Универзитету у Аризони.
Школски центар за одрживу технологију за воду и енергију тестирао је отпадне воде из резиденцијалних сала у кампусу током прве недеље индивидуалне наставе. Открили су присуство САРС-ЦоВ-2 у једном студентском дому. Када су тестирали студенте и особље на тој локацији, идентификовали су две особе које су биле позитивне на вирус, али нису имале симптоме.
Као део стратегије кампуса „Тест, Траце, Треат“, сви студенти су морали да имају негативни тест на антиген пре него што су се могли уселити у домове за становање, наводи се у саопштењу са универзитета.
„Овде је све у вези са временом“, каже Јагдисх Кхубцхандани, ПхД, МПХ, МББС, професор јавног здравља на Државном универзитету у Новом Мексику, за Веривелл. „Мислим да сам данас, ако ме тестирате, надам се - и највероватније - негативан. Али остављаш ме самог на три дана. У тих неколико дана можда сам отишао у локалну прехрамбену продавницу или упознао неке људе и заразио се. “
Хватање случајева пре симптома
Према истраживању Јохнс Хопкинс Медицине, када се особа тестира у раним данима инфекције ЦОВИД-19, резултат може произвести лажно негативан.
За студију која је објављена уАнали интерне медицине, прегледани су подаци из 1.330 узорака који су подвргнути тестирању ланчане реакције реверзне транскриптазе полимеразе (РТ-кПЦР). Истраживачи су израчунавали дневне лажно негативне стопе користећи резултате теста и пријављени датум инфекције или време када су се појавили симптоми.
Према њиховим проценама, особе које су тестиране на вирус током четири дана након што су заражене имале су 67% веће шансе да тестирају негативно, па стога добијају лажно негативне. Тест се показао тачнијим осам дана након инфекције, али чак и тада је лажно позитивна стопа била 20%.
„Чак и када се заразим“, хипотетички објашњава Кхубцхандани, „у почетку првих 7 до 10 дана - или чак две недеље за неке људе - немам симптоме, али и даље настављам да избацујем вирус.“
Универзитет у Аризони преселио је двојицу студената који су имали позитиван тест на ЦОВИД-19 из резиденције у карантин. Студенти ће наставити наставу на мрежи све док не буду могли да се безбедно врате у студентски дом и на личне студије.
Након што су ученици стављени у карантин, школски Центар за одрживу технологију за воду и енергију поново је тестирао отпадне воде студентског дома и није пронашао трагове вируса.
Ако се вирус баци у телесни отпад и потенцијално може да се користи за откривање коронавируса раније од тестова ЦОВИД-19, попут назофаринкса, зашто онда више школа и заједница не тестира узорке урина и фекалија?
„Анализа урина представљала би додатне кораке и оптеретила тестирање“, каже Кхубцхандани. С обзиром на то да су испитивања пренапона и кашњења у заосталим лабораторијама већ проблем, тестирање телесног отпада за појединце био би додатни изазов.
Како тестирати отпадне воде на ЦОВИД-19
Пеацоцк објашњава да Мицробац Лабораториес добија репрезентативни узорак на један од два начина. Прво је оно што се назива граб тестом, где се прикупља случајни узорак. Други је композитни тест, где се поставља инструмент за сакупљање отпадних вода сваких 15 или 20 минута.
Затим се пХ узорка подешава тако да се честице вируса залепе за друге честице, што помаже у филтрирању. Затим се екстрахују нуклеинске киселине и потенцијална РНК вируса и врши се РТ-кПЦР тест. Тест „претвара РНК у комплементарну ДНК", каже Паун. „А онда ту комплементарну ДНК чита наш инструмент."
РТ-кПЦР
РНК је претворена у комплементарну ДНК, синтетички облик ДНК направљен од РНК шаблона.Тест има много примена, од генетике до клиничких истраживања.
РТ-кПЦР тест је иста анализа која се користи за узорке прикупљене из бриса назофаринкса. Међутим, потребан вам је још један показатељ за испитивање отпадних вода. Мицробац такође врши испитивање вируса благог бибера бибера (ПММоВ).
„То је врста најзаступљенијих вируса повезаних са људима у отпадним водама“, каже Паун. Такође се користи за испитивање квалитета воде. „Тај ПММоВ можете користити да бисте знали колико је људског отпада у отпадној води у било ком тренутку“, каже Пеацоцк, наводећи потребу да се разликује од људског и индустријског уноса. „А онда то можете да употребите за уклапање резултата за своје САРС-ЦоВ-2 бројеве.“
Тестирање изван конака
„Корпорације, индустрије, фабрике и градилишта могу бити добра места за процену оптерећења вирусом“, каже Кхубцхандани. На пример, у првим месецима пандемије, погони за паковање меса постали су жаришта избијања ЦОВИД-19. Провера присутности вируса у канализацији биљке могла би да помогне у спречавању будућих избијања.
Др Јагдисх Кхубцхандани, МПХ, МББС
Мислим да оно што морам да нагласим је да је наш највећи изазов са испитивањем канализационе воде или људи: како то превести на јавну адаптацију?
- др Јагдисх Кхубцхандани, МПХ, МББСГрадови би такође могли да користе тестирање за прикупљање података из различитих подсекција заједнице. „Где год имате лифт станицу (пумпа за гориво) или подручје у којем се скупља вода - [било да је то за кварт или за средњу школу - можете то да тестирате“, каже Пеацоцк.
Упркос томе, финансирање и бирокрација и даље могу бити препрека. „У већој ситуацији у заједници постоји пуно додатних трошкова за обогаћивање узорка како би се добио прави тип вирусног оптерећења. А многи градови можда немају такве врсте ресурса. “ Каже Кхубцхандани.
Кхубцхандани такође износи још једно важно разматрање за прикупљање података. „Мислим да оно што морам да нагласим је да је наш највећи изазов са испитивањем канализационе воде или људи: како то превести у јавну адаптацију?“
Ако заједница тестирањем канализације открије висок терет ЦОВИД-19, тада би морале да се догоде агресивније мере социјалног удаљавања и тестирања појединаца у тој заједници.Кхубцхандани додаје да су на крају подаци „корисни само ако постоји процена у реалном времену и акција заједнице вођена том проценом“.
Шта ово значи за вас
Иако ваша заједница можда ускоро неће тестирати канализацију на ЦОВИД-19, прича са Универзитета у Аризони подсећа да се вирус може ширити чак и када немате симптоме. И даље предузимање одговарајућих мера предострожности за социјално дистанцирање, ношење маске и спровођење ефикасне хигијене руку и даље су најбољи начини да заштитите себе, своју породицу и заједницу.